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当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2024-06-18 12:30
    

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本人刚进课题组时,由于经费有限,导师在临床上的工作也非常繁忙,基本处于散养状态,课题组的师兄师姐都是自己想办法毕业的,因此对我来说,需要自己考虑博士开题和毕业的问题。 进课题组后刚开始还是不知所措,问了一圈后发现只有3年前做的一个组学的结果还能用:当时师姐做了脑卒中MCAO的小鼠模型,后来请公司做了6个脑组织样本的转录组测序(时间点是3h,RNA-Seq),其中假手术Sham组与MCAO组(共2组)各3例(3对3),小鼠周龄是8周(并非老年鼠),当时公司也提供了测序的分析结果,主要就是差异基因、功能富集、蛋白互作这些。师姐拿到数据后,挑选了一个基因X首先做了qRT-PCR、WB验证,然后做了小胶质细胞的M1极化表型,后来又检测了一些炎症因子TNFα、IL-1β等,发了一篇3分的文章就毕业了。 后来这个数据一直在那放着,也没有 ………………………………

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