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Mol Cell | 绘制粟酒裂殖酵母转录因子与蛋白和染色质的互作图谱

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-03-23 10:06
    

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撰文 | 章台柳 转录因子 ( TF ) 通过以序列特异性方式与DNA结合并招募效应蛋白来调节基因表达,是基因表达调控中的关键因子。尽管它们起着关键作用,但许多TF的调控靶点和作用机制仍然未知。对单个转录因子的表征扩大了对基因调控的理解。ENCODE等项目展示了TF在全基因组的结合,许多TF的物理相互作用也通过邻近标记或免疫共沉淀-质谱 (IP-MS) 以及酵母双杂交等方法鉴定。然而,这些鉴定方法往往依赖于TFs的异位表达,不能反映生理条件,或者面临抗体可用性等技术挑战。 粟酒裂殖酵母具有保守的调控过程,且与后生动物共享部分遗传特征,是研究基因调控的优秀模型。尽管在揭示基因组调控原理方面发挥了重要作用,但粟酒裂殖酵母的转录因子却很少受到关注。在PomBase15 (2024年3月) 上有93个基因注释为有“DNA结合TF活性” 【1】 ,除 ………………………………

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