eQTL、pQTL联合生信分析超级混合分析思路

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有粉丝问：eQTL、pQTL数据挖掘可以联合生信分析吗？进行多角度互动验证？这个当然是可以的。具体思路和流程如下： 一、数据的下载 1、结局数据 2、eQTL数据 3、pQTL数据 4、生信分析数据 二、数据的整理 1、转换SNP ID 2、合并、计算需要的效应量 3、筛选强相关的SNP 4、剔除连锁不平衡 5、探针名转换为基因名 6、表达数据的标准化处理 三、数据分析 1、批量eQTL MR分析 2、批量pQTL MR分析 3、基因表达差异分析 4、上述阳性结果取交集 四、结果的整理 1、绘制表格 2、绘制图形 相关数据的下载、过滤处理： eQTL批量MR分析： pQTL批量MR分析： 生信分析： 多角度联合分析取交集： 上述分析工作量是非常大的， 特别是下载和整理eQTL、pQTL数据上，需要消耗大量时间的，对电脑和网络要求非常高，普通电脑根本处理不了 ，不过可以直接使用专业人士处理好的数 ………………………………