专家点评Nat Method | 蒋岚团队开发通用型高通量单细胞多组学新技术—UDA-seq

主要观点总结

文章介绍了国家生物信息中心蒋岚团队在单细胞测序技术上的新突破，其研发的UDA-seq技术大幅提高了单细胞测序的通量并降低了成本。该技术兼容多模态，支持常见单细胞多组学，如RNA和ATAC、RNA和CRISPR等的共检测。应用于衰老、疾病人群队列研究及高通量CRISPR筛选研究中，展示了其可靠性和高效性。专家点评表明，该技术在人群尺度的单细胞研究中具有重大意义，将促进新的研究范式和重要规律的发现。

关键观点总结

关键观点1: UDA-seq技术突破

国家生物信息中心蒋岚团队研发的新型单细胞多组学测序技术UDA-seq，通过组合标记技术路线优化升级液滴微流控平台，成功实现细胞通量和假单细胞率的“解偶联”，突破通量限制。该技术兼容多模态，同时将单通道细胞通量提高到刷新记录的10万细胞以上。

关键观点2: UDA-seq应用场景及优势

UDA-seq技术应用于衰老、疾病人群队列研究及高通量CRISPR筛选研究。通过对微量冰冻血液样本和微量冰冻活检样本的处理，获取高质量、多模态、单细胞精度数据。建立了从微量样本中获取高质量数据的解决方案，并大幅降低了单例样本的数据成本。

关键观点3: 专家评价与影响

专家对UDA-seq技术评价高，认为其在兼容多模态的同时大幅提高了单细胞测序的通量，为建立可预测可编程的虚拟细胞基础大模型提供了数据支撑。此外，该技术的突破将促进高通量单细胞多组学测序在医学应用中的落地，对疾病研究、新型诊疗开发具有重要意义。

文章预览

点评 | 汤富酬/ 谢昊玲 （北京大学）、 张学工/ 高浩翔   （清华大学）、 乔杰 （北京大学）、 金力 （复旦大学） 细胞是生命的基本单元。近年来，单细胞组学技术的快速发展前所未有地革新了人类对细胞多样性和异质性的认知，推进了生物医学重大规律的发现，为建立可预测可编程的虚拟细胞基础大模型提供语料。细胞图谱技术被Nature期刊列为2024七大关注技术之一。2024年11月，国际人类细胞图谱计划在Nature期刊及其子刊发表了40余篇论文合集，标志着“细胞身份普查”取得了阶段性成果。下一阶段的重心，则是单细胞多模态和人群尺度的研究，深入解析遗传背景、环境、病理条件与性状和表型之间的复杂互作。然而，当前的单细胞多组学技术的成熟度严重滞后于单细胞转录组技术，在人群队列的大规模研究中面临着通量、普适性等诸多挑战 ………………………………