专栏名称: 生信菜鸟团
生信菜鸟团荣誉归来,让所有想分析生物信息学数据的小伙伴找到归属,你值得拥有!
今天看啥  ›  专栏  ›  生信菜鸟团

R语言入门15:实战:TCGA数据下载和整理

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-11-04 19:03

文章预览

为了方便大家学习,我已经录制了 配套的视频 ,放在了哔哩哔哩(我的B站账号: 阿越就是我), 免费观看 ,复制以下网址粘贴到浏览器打开即可: https://space.bilibili.com/42460432/channel/collectiondetail?sid=3740949 本期目录: 从官网下载TCGA数据 表达矩阵整理 添加行名和列名 获取样本名和文件名的对应关系 easyTCGA 选择TCGA数据下载和整理,原因主要有以下几个: 够复杂但不超纲,能够用到非常多前面介绍的知识,这些内容也全部都是R语言的基础知识; 够实用,TCGA数据下载和整理是很多人都需要的知识,但是很多初学者不会做; 前后对比,先介绍一个很复杂的方法,再介绍一个很简单的方法,要善于使用工具! 从官网下载TCGA数据 请跟着视频操作。 TCGA官网:https://portal.gdc.cancer.gov/ 表达矩阵整理 查看所有文件: allfiles "tcga_meso", pattern =  ".tsv" ,      ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览