学术技能｜如何解读UniProt的GO可视化图表信息

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在实用的蛋白质数据库网站UniProt中，单一蛋白的页面会有一个叫GO annotations的版块。GO即Gene Ontology，基因本体论。此处可以简单理解为规范化统一表述基因本身的结构与能决定的生物功能。 当我们接手一个课题而不知道目标蛋白有什么功能，或如何设计实验（通过操作什么蛋白）评估假设的时候，可以在这里看到前人对该蛋白的GO字节留下的功能注释，据此了解目标蛋白的功能，然后设计实验。 以ARK2为例，我们可以看到在这个部分，UniProt按Cellular Component（细胞组分）、Molecular Function（分子功能）与Biological Process（生物学过程）分为三类，在每一个有相关研究和推论的部分附有名称，点击后面的超链接按钮可以看到解释，而source按钮可以看到结论从何而来。 比如点击有蓝色标记的transferase activity（转移酶活性），可以看到这个标记属于分子功能类 ………………………………