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除了恶性和非恶性人类细胞外，肿瘤微环境（TME）还由包括病毒、细菌和真菌在内的微生物组成，统称为肿瘤微生物组，最近肿瘤微生物组的研究日益受到关注。今天分享一篇 2024年5月cancer data Science laboratory, center for cancer Research, national cancer institute USA团队发表在 science advances（IF：11.7） 的分析文章。该研究开发了一个新的流程 CSI-Microbes，用于从基于板和基于液滴的 scRNA-seq 技术中识别微生物读数，区分细胞内细菌读数和污染物读数，并确定富含细菌读数的细胞类型。同时生成了一个新的数据集，本文称为 Robinson2023，其中包含体外暴露于具核梭杆菌的多个细胞系，以及使用多种 scRNA-seq 技术测序的适当对照。 添加微信 精彩推送不错过 一、 主要结果 1.CSI-Microbes概述 首先作者开发了一个计算管道 CSI-Microbes (https://github.com/ruppinlab/CSI-Microbes-identificatio
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