SCENIC+效果不好？新的GRN算法 LINGER | Nat.Biotechnol |

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Basic Information 英文标题：Inferring gene regulatory networks from single-cell multiome data using atlas-scale external data 中文标题：使用图谱规模的外部数据从单细胞多组学数据推断基因调控网络 发表日期：12 April 2024 文章类型：Article 所属期刊：Nature Biotechnology 文章作者：Qiuyue Yuan | Zhana Duren 文章链接：https://www.nature.com/articles/s41587-024-02182-7 Abstract Para_01 现有的基因调控网络（GRN）推断方法依赖于单一的基因表达数据或较低分辨率的批量数据。 尽管最近整合了染色质可及性和RNA测序数据，但从有限的独立数据点中学习复杂机制仍然是一个巨大的挑战。 在此，我们介绍了LINGER（用于基因调控的终身神经网络），这是一种从单细胞配对的基因表达和染色质可及性数据中推断GRNs的机器学习方法。 LINGER结合了跨不同细胞环境的大规模外部批量数据以及转录因子基序的先验知 ………………………………