单细胞视角|ELLIPSIS解析基因剪接奥秘、tagtango让细胞注释比较更简单直观空间组学新工具CLPLS、SIMO 等

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1 ELLIPSIS工具助力精准解析基因剪接奥秘 ❝ 文章：ELLIPSIS: Robust quantification of splicing in scRNA-seq 链接：https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaf028/8010256 代码：https://github.com/MarchalLab/ELLIPSIS.git 传统的可变剪接研究通常依赖于大量细胞群体的数据，但这种方法掩盖了单个细胞之间的差异性。每种细胞类型都有其独特的剪接模式，因此需要能够在单细胞RNA测序数据中识别剪接事件的方法。然而，scRNA-seq 数据具有低覆盖率和不均匀性的问题——即基因的某些部分可能没有被充分读取。这种技术限制使得检测可变剪接事件变得异常困难。为了解决这一难题，比利时根特大学的研究团队开发了一款名为 ELLIPSIS 的工具。这一创新技术为单细胞剪接研究开辟了新天地。 ELLIPSIS 的设计旨在解决scRNA-seq数据的低覆盖率和不均匀性问题，其工作 ………………………………