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来抄作业——曼哈顿图,汇总展示【多种通路】的富集显著性

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-11-13 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 今天继续给大家画图 —— 曼哈顿图 同时展示多个范畴 ( 即多个数据库 ,eg: KEGG、GO、REACTOME、TF、WIKIPATHWAY 等 ) 通路的显著性 。 效果如下 (这里同时展示 GO 三大类+KEGG = 四种类型的通路 ): 数据导入 library (dplyr) load( "enrich.res.Rdata" ) GOsource "GO:BP",  "GO:CC" ,  "GO:MF" ,  "KEGG" ) GOcolors "#CB2027",  "#059748" ,  "#EE7733" ,  "#7B3A96" ) df %>% filter( source  % in % GOsource) -> GOmat # > table(GOmat$significant) # FALSE  TRUE #  1118   139 数据处理 ………………………………

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