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代谢物差异结果有谁在?柱状图、 (O)PLS-DA得分图、检验图……

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-06-30 12:54
    

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做代谢物差异分析时,总疑心结果文件是不是缺少了什么?通常(O)PLS-DA分析输出的图包含差异代谢统计柱状图、(O)PLS-DA得分图、模型检验图等,对后续分析生物学意义、做更深入的研究有重要影响。 在使用Omicshare的(O)PLS-DA工具时常有同学问xx图怎么没有?xx图在哪个文件夹?xx的数据表没找到?其实结果文件夹中有不少惊喜,想要的图和数据基本都在!!一起回顾从数据整理到结果文件夹的“揭秘”~ 数据整理 共有3个上传文件,参照示例文件,代谢物定量表第一行为样本名,第一列为代谢物ID,输入代谢物定量数据,保存为txt/csv/xls/xlsx格式均可; 分组文件第一列为代谢物定量表的列名(样本名),第二列为自定义的分组名;即使没有重复、一个样本为一组,也必须上传分组文件;比较组文件一行为一个比较组,第一列为对照组,第二列为处理组, ………………………………

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