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scMaSigPro—沿单细胞轨迹的差异表达分析

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-10-31 08:00
    

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点击👇下方,关注益站 。 生信益站,一点就有益 ! 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 文献或者算法分享— —scMaSigPro:沿单细胞轨迹的差异表达分析 。 动机 了解不同细胞状态下基因表达的动态对于辨别细胞分化背后的机制至关重要 。 平均表达随拟时间和分支轨迹变化的基因有望控制细胞命运的决定 。科学家开发了 scMaSigPro , 这是一种同时识别拟时间和分支路径上差异基因表达模式的方法 。 结果 研究人员使用合成和公共数据集评估了scMaSigPro的性能。评估表明, scMaSigPro在控制假阳性方面优于现有方法,并且计算效率高 。 文章回顾 : Bulk转录组时序分析之 :《 maSigPro-时程基因表达谱中的显著基因表达差异分析 》 引言 单细胞 RNA 测序 (scRNA-Seq) 数据集,尤其是那些以细胞分化和过渡实验为特色的数据集,极大地受益于轨迹 ………………………………

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