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之前,在 《如何使用DeepSeek绘制好看的热图?》 、 《如何使用DeepSeek绘制添加基因标签的火山图?》 、 《使用DeepSeek绘制8种常见的科研图表》 等文章中为大家介绍了如何使用DeepSeek绘制各种科研图表,那么,使用DeepSeek可以进行GO、KEGG富集分析么? 接下来,就以一份具体的数据为例,看下如何使用DeepSeek+Rstudio进行GO、KEGG富集分析并绘制下图这般的富集网络图! 1. 使用DeepSeek进行GO、KEGG富集分析 富集分析的数据准备很简单,只需整理单列的目的基因列表即可,如下图,基因ID的类型可以是NCBI Gene ID、Gene Symbol、Ensembl ID等。 然后,打开DeepSeek上传范例数据文件。将示例数据文件直接复制粘贴到对话框中即可上传文件,当然也可点击“曲别针”按钮上传附件。DeepSeek支持Excel文件、制表符分隔的文本文件等,我这里上传的是制表符分隔的TXT格式文件。
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