专栏名称: 生信分析手册
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7+线粒体+分型+机器学习+实验验证,干湿结合助力线粒体相关基因分析,事半功倍!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-22 14:46

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ MTFR2-dependent mitochondrial fission promotes HCC progression”,这篇文章发表在 J Transl Med 期刊上,影响因子为7.4。 结果: HCC中线粒体动态基因的特征 在23个线粒体动态基因中,21个基因(DNM1L、MTFR2、ARL2、MFN1、MIGA1、MIGA2、MTCH2、OMA1、OPA1、PLD6、ARMC10、FIS1、MFF、MIEF1、MIEF2、MTFP1、MTFR1、MUL1、RAB24、SLC25A46、SPIRE1)在HCC组织中较正常显著上调,其表达水平的热图如图所示。2一个。DEGs的共表达网络显示MTFR2和DNM1L的表达水平呈正相关(图1)。2以及由这 21 个 DEG 编码的这些蛋白质之间的相互作用如图所示。2C. 线粒体动态基因的共识聚类确定了两组具有不同病理特征、线粒体状态和临床预后的HCC患者 根据已知动态基因的表达,当k = 2时观察到“最干净”的聚类(图1)。3A-H)。当k = 2时,簇在组内的相关性最高,组间干扰最 ………………………………

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