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听说你想做一个真正意义上的参考基因组,造福全人类?

生信石头  · 公众号  ·  · 2024-08-21 09:58

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写在前面 2022年国庆节,一时兴起想花 2 个小时试试想法,于是有了 GSAman,结果就是现在 2024年,仍然不时在更新。2023年一年,其实确实是更新了不少特性,也重写了不少逻辑,现在软件更稳健,用起来也更舒服。为此,重新汇总一下,方便大伙了解。 1.安装 GSAman 安装 GSAman 非常简单 2.导入 GSAman Track 3.鼠标拖拽调整外显子边界 键盘摁住 CTRL ,鼠标拖拽 4.快速跳转到附近基因位置(Alt+J) 5.直接复制CDS/mRNA序列 6.实时自动检测可变剪切位点 7.便捷展示丰富的注释信息 8.时光机/撤回操作(Alt+Z) 9.切换链方向着色 10.调用Augustus预测基因结构 11.借助Softberry进行基因结构预测 12.基于输入序列调用BLAT重构基因结构 13.增加一个新转录本/新基因(Alt+N) 14.复制一个转录本(Alt+C) 15.对转录本进行重命名(Alt+R) 16.分割一个转录本为两个 17.合并多个转录本为一 ………………………………

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