假期快要结束！！满满的干货——细胞通讯分析软件比较和总结

文章预览

上期我们介绍了 《空间通讯分析：揭示细胞对互作网络的新视角》 ，还有前面两期，主要介绍细胞通讯分析软件的原理、应用思路、结果可视化等，本期我们对细胞通讯分析常用软件CellphoneDB、CellChat做一个系统性的比较，让大家对细胞通讯分析内容有更深入的理解，也可以在自己的项目分析中更加使用自如。 《先收藏！史上最详细的细胞通讯CellphoneDB原理和应用思路》 《细胞通讯CellChat工作原理及应用思路》 本期内容：两种软件自带的数据库比较、算法原理比较、应用情景推荐。 一、数据库比较 1 CellphoneDB和CellChatDB的不同比较 这两种数据库适用的物种有所不同，数据库也各有特色，其中CellphoneDB依靠受体-TF的互作关系，为配受体互作关系的结果准确性提供辅助依据，而CellChatDB依靠KEGG通路的上下游辅助因子，为配受体互作关系的结果准确性提供 ………………………………