主要观点总结
本文描述了作者在基因家族分析领域中经常遇到的基因结构注释问题，包括基因家族成员序列的错误、注释错误导致的图片和表格需要重做等。作者提出了三个阶段的解决办法，包括开发TBtools的Re-construct GXF、IGV-GSAme和IGV-GSAman，并强调了高质量序列需要高质量注释的重要性。文章还介绍了基因结构注释人工矫正软件GSAman的特性和使用方式。
关键观点总结
关键观点1: 基因家族分析中的常见问题
作者在基因家族分析领域经常遇到基因结构注释问题，如串联重复基因被错误注释、注释错误导致的图片和表格需要重做等。
关键观点2: 作者提出的解决办法
为了解决这些问题，作者开发了三个工具：Re-construct GXF、IGV-GSAme和IGV-GSAman。这些工具旨在帮助用户更好地进行基因结构注释和调整。
关键观点3: 高质量注释的重要性
作者强调，高质量的序列需要高质量的注释才能成为高质量的参考。对于基因功能研究和基因家族分析的朋友来说，正确的注释非常重要，可以避免数年努力白费。
关键观点4: 基因结构注释人工矫正软件GSAman的介绍
作者介绍了基因结构注释人工矫正软件GSAman的特性和使用方式，并提供了相关文档和链接供读者了解和使用。
文章预览
写在前面 不知为何，几乎每天我都会收到一些「基因家族分析」的论文审稿邀请，其中质量参差不齐，但有不少论文作者团队非常友好，总是留下一个非常好提问机会。那就是「基因家族成员序列有问题」这意味着， 得重做 。对于一个以「基因家族分析」为主题的工作来说，往往相关表格和图片都得重新来。如果不小心，用了错误的基因序列做功能验证，那更是白费一年时间。 当然，对于审稿人不小心的情况，也比比皆是。简单通过 google scholar 搜索，可以很快找到一大堆 已发表的论文 ，从主图来看，有经验的审稿人一眼就看出问题。这个错误的责任，20%归结于发布基因组的人，更有80%归结于进行基因家族鉴定工作的人。后者，我觉得还是要精细一些。 几个示例 上图由于串联重复基因被注释成一个，从 motifs pattern 就可以看出来问题。 图片得
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