主要观点总结
ImageGP 2.0是一个用于生物医学研究的在线数据可视化和分析平台,它在原有功能基础上进行了升级和增强,提供了数据格式转换模块、数据预校验模块、更多可视化功能和数据分析工具,以及用于管理大型数据集和分析历史的用户中心。此外,它还增加了R包ImageGP,实现了线上和本地数据可视化和分析的联动。这些更新使ImageGP 2.0成为一个功能更加完善、涵盖分析方法更多的多功能生信工具平台,为生物医学研究提供了有力的支撑和保障。
关键观点总结
关键观点1: ImageGP 2.0的功能概述
ImageGP 2.0是一个升级版的在线数据可视化和分析平台,具有数据格式转换模块、数据预校验模块、更多可视化功能和数据分析工具,以及用于管理大型数据集和分析历史的用户中心。
关键观点2: 数据格式转换模块
ImageGP 2.0增加了数据格式转换模块,支持矩阵合并、矩阵筛选以及长、宽矩阵格式的转换,为后续绘图和分析工具提供直接可用的数据。
关键观点3: 数据预校验模块
通过数据预校验、分组相似属性参数、折叠不常用参数等功能,降低了使用成本,提高了数据的准确性。
关键观点4: 更多的可视化功能和分析工具
ImageGP 2.0增加了更多可视化功能和分析工具,包括WGCNA分析、差异基因表达分析和FASTA序列处理等,为用户提供了更多的选择和灵活性。
关键观点5: 用户中心
用户中心允许用户上传大型数据集、跟踪分析历史、共享分析数据、脚本和结果等,增强了用户对数据的管理和控制。
关键观点6: R包ImageGP的联动
R包ImageGP的集成将线上和本地功能联动,解决了湿实验室和干实验室环境中数据管理、分析和安全相关的难题,实现了数据的本地处理和线上分析的无缝对接。
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点击蓝字 关注我们 ImageGP 2.0:用于生物医学研究的强大数据可视化与可重复性分析工具 方法论文 ● 期刊: iMeta (IF 23.7) ● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.239 ● 2024年9月12日,中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队在 iMeta 在线联合发表了题为“ ImageGP 2 for enhanced data visualization and reproducible analysis in biomedical research ”的文章。 ● 本文在升级版ImageGP 2.0(https://www.bic.ac.cn/BIC/#/)中,引入了最新网络开发技术,重新设计了用户使用界面,大大丰富和增强了原有功能,并显著改善了用户使用体验。 ● 第一作者:陈同 ● 通讯作者: 陈同( chentong_biology@163.com ),刘永鑫( liuyongxin@caas.cn ),黄璐琦( huangluqi01@126.com ) ● 合作作者:陈涛、杨莓、范思庆、石鸣磊、魏步青、吕慧娇、曹万迪、王崇铭、崔建
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