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柑橘是十分重要、种植十分广泛的果实作物之一，基因组大约为327Mb，是一种木质多年生植物，其果实属于非呼吸跃变型果实【呼吸跃变型果实成熟伴随着呼吸和乙烯水平的急剧上升，而非呼吸跃变型果实则没有这种变化】。 对于不同植物来讲，果实成熟都是一个十分复杂的发育过程，涉及到很多生理、生化以及结构上的变化，包括颜色的变化、营养物质的积累、果实质地的变化等。 DNA甲基化是一种主要的、保守的表观遗传标记，与基因组稳定性、转录失活、发育调控以及环境响应密切相关。DNA甲基化的动态变化对于果实成熟过程十分重要。例如：番茄果实成熟过程中DNA去甲基化酶基因SlDML2的表达增加，导致果实出现全局性的DNA去甲基化，并对下游的数百个基因的表达具有影响作用；苹果中MdMYB10启动子的DNA甲基化可以影响果实成熟过程中色素的
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