Science：人类大脑的单细胞DNA甲基化和3D基因组结构

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高通通量表观基因组分析技术可用于阐明大脑中细胞复杂性的基因调控程序。 5'-甲基胞嘧啶 (5mCs)是哺乳动物基因组中最常见的修饰碱基，大多数5mCs发生在胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸（CpGs）上。CG差异甲基化区域 (DMRs)通常是顺式调控元件（CREs）的标志。在脊椎动物的神经系统中，5mCs也在非CpG（或CH，H=A、C或T）中被大量检测到。CG和CH甲基化（mCG和mCH）在大脑发育过程中高度动态变化，并表现出细胞类型特异性。mCG和mCH对于基因调控和大脑功能至关重要。因此基因调控需要适当的染色质折叠3D构象，这些构象被组织成活性（A）或抑制性（B）区、拓扑关联域（TADs）和染色质环（chromatin loops）。这些3D结构促进了基因启动子与其调控元件之间的互作，提供了额外但关键的调控机制层面。DNA甲基化与染色质构象互作，且过程高度相关。基于高通量表观基因组 ………………………………