0基础带您入门代谢组学（3）

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一、数据格式 数据处理旨在从获取的数据中提取生物学相关信息。它包括许多在质谱（MS）和核磁共振（NMR）中类似的步骤。对这些步骤有良好的理解非常重要，以尽量减少结果偏差或错误的风险。通常，MS 和 NMR 代谢组学研究的终点是一个（注释过的）特征矩阵，如下图所示。一个特征通常是表示化合物的峰或信号。因此，特征矩阵包含每个样本中相关信号的强度或（相对）丰度，描述了代谢组学的指纹。最终，这个特征列表将成为一个具有半定量或定量值的已鉴定代谢物列表。矩阵的转置形式也很常见。 在构建特征矩阵之前，进行降噪和背景校正是必不可少的，这些步骤能够在峰提取过程中通过峰识别来提取特征。此过程极大地优化了数据。随后，各样本的提取特征会在样本间对齐，以补偿化学位移（NMR）或保留时间（MS）的漂移，如下图所 ………………………………