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Nat Commun(IF 14.7):跨物种分析再添利器,张世华/张淑芹团队开发人鼠全脑空间转录组比对工具BrainAlign

生信学霸  · 公众号  ·  · 2024-10-09 15:05

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Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign 动物模型在神经科学研究中至关重要,在理解疾病、设计治疗方法和获取人类无法获得的数据方面发挥着至关重要的作用。由于小鼠模型在人类神经科学研究中的广泛应用,需要开发计算方法将小鼠脑部的研究结果转化为人类脑部的结果。然而由于从8000万年前开始的重大进化分歧,在全脑水平上将研究结果从小鼠映射到人类并不简单。 Nature Communications  上发表的新文章通过 自监督学习和异质图神经网络技术成功开发了人类和小鼠大脑空间转录组数据的跨物种对齐工具BrainAlign ,揭示了跨物种保守的基因表达模式和大脑区域。 代码全公开:https://github.com/zhanglabtools/BrainAlign 期刊:Nature Communications(IF 14.7) 出版商:Springer Nature 发表:2024年7月30日 DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-50608-2 ………………………………

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