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如何从单细胞测序数据中挑选基因?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2024-08-04 12:30

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本期主题为 当导师只给我一个单细胞测序数据,我是怎么设计4个课题的…… (单击链接查看) 系列的第二期,上期我们重点说的是细胞群,即 如何从单细胞最常规的分析中发现感兴趣的细胞群 ,分别从 细胞比例变化和功能异常 两个角度展开说的,并说明了如何开展以特定细胞群为主题的研究内容。 本期我们继续说如何解读和分析单细胞测序数据,并从中发现线索后用于项目申请,与第一期不同的是,本期的主要围绕“ 从细胞的角度进行基因选择 ”来说明,并分为 6 个角度展开: 1.从挑选细胞类型共同和特异性差异基因 不同细胞类型中共同差异表达(升高或者降低)的基因 ,这类基因由于在多个细胞类型中都共同显著升高或者降低,所以在常规 RNA 测序中也是一致性比较高的,常见的热图形式是这样的: 而另外一类基因是 细胞类型特异性 ………………………………

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