Github代码文献复现之卵巢和子宫内膜癌（三）|| 双细胞过滤之 DoubletFinder

文章预览

我们的新专辑《 Github带有全套代码分享的文献复现2025 》开启后受到大家的热烈喜爱，里面学习的文章为：《A multi-omic single-cell landscape of human gynecologic malignancies》，前面的学习笔记如下： Github带有全套代码分享的文献复现2025 Github全套代码文献复现之卵巢和子宫内膜肿瘤（二）|| 作者不进行 UMI count 回归的原因 今天继续来学习他的代码，代码部分接上面的稿子，做完了数据预处理，保存的对象为 saveRDS(rna,"./rna_predoublet_PassedPC1Checks.rds") 。 今天的学习内容： 今天主要学习作者 对双细胞进行过滤，这里主要使用了两款软件 DoubletDecon 和 DoubletFinder Doublets及其形成的原因 10X单细胞平台的dulblets比率 Chromium Next GEM Single Cell 3ʹ Reagent Kits v3.1 User Guide • Rev D DoubletFinder算法预测双细胞 这个软件于2019年4月24发表在 Cell Systems（2021年影响因子 11.091），文献标题为 ………………………………