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9分+!肠道菌群+孟德尔随机化思路,就是如此的惊艳!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-02 19:11

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章 Gut microbiota, circulating cytokines and dementia: a Mendelian randomization study ”,这篇文章发表在 J Neuroinflammation 期刊上,影响因子为9.3。 结果: 工具变量选择 最初,作者在类、科、属、目和门的水平上,分别确定了与210个肠道微生物群相关的224、478、1667、280和125个SNP,P值小于1 × 10 –5 (由于没有符合条件的SNP,其中一个肠道微生物群被排除在外)。这些2774个SNP被选为210个肠道微生物群分类的工具变量(附加文件3:表S2)。然后,作者在P值小于5 × 10 –6 的水平上,确定了与41种细胞因子相关的451个SNP(附加文件4:表S3)。 肠道菌群和细胞因子对多种痴呆类型的因果效应 与AD相关的共有六种肠道微生物群落(包括一个家族、四个属和一个目)(附加文件5:表S4,图2)。六种肠道微生物群落的61个SNP详细信息请参见附 ………………………………

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