NAR | 做qPCR实验更简单！西南大学卢坤等团队更新了基因特异性qPCR引物数据库，涵盖1172种生物

文章预览

高质量的引物设计对于所有基于聚合酶链反应(PCR)的实验的成功至关重要。 研究之前建立了一个基于热力学的基因特异性定量PCR (qPCR)引物数据库，用于147个生物的基因表达研究。 然而，数据库中生物的数量和功能的不完善限制了其潜在的应用。 2024年8月9日，西南大学 卢坤、李田、 张凯 在 Nucleic Acids Research  在线发表题为 “ qPrimerDB 2.0: an updated comprehensive gene-specific qPCR primer database for 1172 organisms ” 的研究论文， 该研究 改进了qPrimerDB的功能，以创建一个更全面的引物资源。 具体而言，(i)开发了一种改进的引物设计工具qPrimer，基于之前的qPrimerDB管线，以提高基因组规模qPCR引物设计的效率和简单性；(ii) 从1172个生物的1308个基因组中预先计算qPCR引物资源 ；(iii)引入了一个完整的qPCR引物鉴定、设计、检查、标记和提交系统。 qPrimerDB2.0可在https://qprimerd ………………………………