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“花开两朵,各表一枝”丨清华大学蓝勋团队合作背靠背发表两篇NCB

iNature  · 公众号  ·  · 2024-07-10 09:00
    

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iNature 器官发生是一个高度复杂和精确调控的过程。 2024年7月8日, 清华大学蓝勋团队 在 Nature Cell Biology  (IF=17)  发表题为 “ A single-cell atlas of chromatin accessibility in mouse organogenesis ” 的研究论文, 该研究通过SPATAC-seq在单个实验中分析了13个小鼠胚胎在胚胎日(E) 10.5至E13.5四个发育阶段的>35万个细胞的染色质可及性。 结果图谱揭示了43种主要细胞类型中830,873个候选顺式调控元件的状态。通过整合染色质可及性图谱和先前的转录组数据集,表征了与细胞命运承诺相关的顺式调控序列和转录因子,如胃肠道发育中的 Nr5a2 ,这在斑马鱼体内实验中得到了初步支持。最后,将该图谱与先前来自13只成年小鼠组织的单细胞染色质可及性数据集相结合,描绘了不同细胞类型内部和之间的发育阶段特异性基因调控程序,并确定了谱系发育过程中潜在的分子开关。 这 ………………………………

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