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Science | 最新研究揭示:罕见胚系结构变异增加儿童实体瘤风险,预计可解释1.1%-5.6%的儿童癌症易感性

测序中国  · 公众号  ·  · 2025-01-09 15:38
    

主要观点总结

儿童实体瘤是儿童癌症的主要类型之一,占每年新诊断儿童癌症病例的三分之一。研究发现在儿童实体瘤发病机制中,胚系遗传因素起重要作用。美国哈佛医学院Broad研究所等机构的研究人员在最新研究中发现罕见胚系结构变异(SV)会增加儿童实体瘤的风险。该研究对神经母细胞瘤、尤文氏肉瘤和骨肉瘤患者进行了全基因组测序分析,发现了导致基因破坏和表达异常的罕见胚系SV。研究预计罕见胚系SV解释了儿童癌症易感性的重要部分。

关键观点总结

关键观点1: 罕见胚系结构变异(SV)增加儿童实体瘤风险。

研究发现,罕见胚系SV与儿童实体瘤的发病风险增加有关,特别是在男孩中,非常大的胚系染色体异常与风险增加存在性别偏好关联。

关键观点2: 研究发现涉及多种类型的儿童实体瘤。

研究涵盖了神经母细胞瘤、尤文氏肉瘤和骨肉瘤等多种儿童实体瘤,发现罕见胚系SV在这些肿瘤中的影响各不相同,其中在神经母细胞瘤中的影响最大。

关键观点3: 研究使用全基因组测序分析寻找罕见胚系SV。

研究团队使用基于云的流程GATK-SV对儿童和成人对照进行了全基因组测序分析,以寻找与儿童实体瘤相关的罕见胚系SV。

关键观点4: 罕见胚系SV影响基因表达和癌症发展。

研究发现,患者的SV倾向于破坏其在癌源组织中高表达的基因,这些SV导致的异常表达在患者的肿瘤中表现出来。此外,研究还发现了数十个影响癌症易感基因的胚系SV。

关键观点5: 研究预计罕见胚系SV可解释部分儿童癌症易感性。

研究预计罕见胚系SV可以解释1.1%-5.6%的儿童癌症易感性,成为疾病易感性的一个重要组成部分。


文章预览

儿童实体瘤占每年新诊断儿童癌症病例的三分之一,是儿童发病率和死亡率的一个主要原因。胚系遗传因素被认为在儿童实体瘤发病机制中起重要作用,但目前公认的相关易感基因仅占所有诊断的10%-15%。因此,确定更多的胚系风险因素将有助于加深对儿童实体瘤的生物学理解,进而为临床管理和治疗提供支持。 此前大多数儿童实体瘤的胚系遗传研究都集中在短变异上,特别是单核苷酸变异(SNV)和小片段插入或缺失(Indel)。结构变异(SV)是一类研究相对较少的胚系变异。 美国哈佛医学院Broad研究所联合Dana-Farber癌症研究所的研究人员假设罕见胚系SV有助于儿童实体瘤易感性,并开展研究评估了它们在神经母细胞瘤、尤文氏肉瘤和骨肉瘤中编码和非编码基因组区域的影响。 近日,该研究的最新成果发表在 Science 上,文章题为“Rare germline structural v ………………………………

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