专栏名称: 生物学霸
「生物学霸」是丁香园旗下科研资讯平台。专门为科研人员打造,致力于让科研更简单更快乐。
目录
今天看啥  ›  专栏  ›  生物学霸

干货 | 最全汇总:掌握这些基因组 MGE 识别数据库,分析工作不用愁!

生物学霸  · 公众号  · 生物  · 2019-08-27 17:00

文章预览

移动遗传元件 (Mobile genetic elements, MGEs ) 如质粒、噬菌体、基因组岛、转座子和插入序列等是能够在细胞内外移动、携带编码特定功能基因的基因组片段,在生物体 基因转移 和 基因重组 方面以及 物种进化 方面起着不可小觑的推动和调节作用,并且一直是研究的热点。 MGE 也是横向基因转移事件的指示物,代表着生物体对不同环境的主要适应性机制。 如何准确预测基因组中的 MGE 并进行分析一直是大家关注的问题,今天就为大家介绍一些可以识别 MGE 的数据库: IslandViewer4 ISFinder PHASTER ACLAME CENSOR、RepeatMasker 与 HTT-DB 熟练使用后将方便大家之后的分析工作。 一、使用 IslandViewer4 识别基因组岛 基因组岛 是细菌或古细菌基因组中位置相邻的外源基因集群,通常与 tRNA 基因 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览