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JIPB | 河南大学张学斌团队开发植物代谢组学数据分析流程:MetMiner

生信石头  · 公众号  ·  · 2024-09-14 11:33

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植物代谢组学作为一门新兴的组学技术,被广泛应用到代谢途径解析、基因功能解析以及作物品种改良等领域,展现出巨大的潜力。随着质谱技术的发展及检测成本的降低,群体规模的植物代谢组学检测需求日益增加,然而,针对大样本量的代谢组学数据处理及数据挖掘的流程开发相对滞后,现有的流程大部分由各个实验室自行搭建,且要求使用者具有一定的编程经验。因此,开发一款用户友好的大规模植物代谢组学数据分析流程具有重要意义。 JIPB 近日在线发表了河南大学 张学斌 团队题为 “MetMiner: A user-friendly pipeline for large-scale plant metabolomics data analysis” 的论文 ( https://doi.org/10.1111/jipb.13774 ),介绍了一款用户友好的,专为大规模植物代谢组学数据处理及数据挖掘打造的分析流程MetMiner。 MetMiner分析流程由三部分构成:第一部分为上游数据处理 ………………………………

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