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揭示 APOD 作为胃癌生物标志物的潜力:一项回顾性和多中心研究

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-05-28 11:35

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今天给同学们分享一篇生信文章“ Uncovering the potential of APOD as a biomarker in gastric cancer: A retrospective and multi-center study ”,这篇文章发表在 Comput Struct Biotechnol J 期刊上。 结果: APOs在泛癌中的差异表达及其与临床特征的关联 为了研究APOs在全癌症中的表达模式,作者利用TCGA的全癌症数据计算了肿瘤组织和相邻正常组织之间APOs的差异表达。热图分析显示了APOs的表达水平存在差异,其中APOA1、APOD和APOH等基因在大多数癌症中普遍下调,而APOC1和APOC2等基因在许多癌症中上调。即使在同一种癌症类型中,如COAD、KICH和STAD,APOs的表达趋势也存在显著差异(图1A)。随后,作者进行了CoxPHs分析,以分析APOs表达与全癌症预后之间的关系,结果显示APOs表达对全癌症预后的影响高度变化,特定基因在不同肿瘤中的预后影响相反(图1B)。此外,相关性分析发现了特定AP ………………………………

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