Nature | 蛋白质遗传结构很复杂？Ben Lehner使用加性能量模型得出相反结论！

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DRUG AI 今天为大家介绍的是来自Ben Lehner团队的一篇论文。序列长度为100的蛋白质可能的氨基酸序列组合超过个，而已知宇宙中的原子数远少于这个数量。在如此庞大的序列空间中，无论是实验还是计算，都只能探索其中极小的一部分。近年来，深度神经网络越来越多地用于探索高维序列空间。然而，这些模型极其复杂。作者通过从大于的序列空间中进行实验采样，证明至少某些蛋白质的遗传结构非常简单，可以通过完全可解释的能量模型在高维序列空间中准确预测遗传特性。这些模型能够捕捉自由能与表型之间的非线性关系，但总体上由自由能的加性（additive）变化组成，只有少量的两两能量耦合作用。这些能量耦合作用稀疏，且与结构接触、主链的接近性相关。结果表明，蛋白质的遗传实际上既简单又容易理解。 大规模并行实验可以全面量化蛋 ………………………………