专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

代码分享|| 还不知道单细胞与空间转录组数据整合的就看这篇Cancer research!提供了超详细的MIA分析代码

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-07-01 08:35
    

文章预览

生信技能树一直致力于华语地区生信知识的普及,本次针对多年来呕心沥血整理的资源来给大家进行资源分享,包括但不限于介绍带有完整代码和数据的图表复现资源,不同大学免费公开的公开课介绍,免费电子书籍资源介绍等~ 本次分享的文献是一篇单细胞与空间转录组数据分析的典范! 提供了超详细的整合代码MIA分析方法 ,可能与你自己写的超几何分布代码不一样哦~ 部分代码展示 文章还给我们展示了空间转录组与单细胞整合分析的MIA代码部分:超几何分布处理的细节 #################################################################################### ###### Author: Ying Zhu ######  ### This code performs the following operations: ### 1. Load DEG of scRNAseq from PLoS One. 2018; 13(11): e0206785 ### 2. Load DEG of ST data ### 3. Compute MIA (multi-modal intersection analysis) ### 4. Make heatm ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览