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25样本的单细胞加空间组就能发NC,快看看怎么做的

生信师兄  · 公众号  ·  · 2024-08-12 20:31

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今天分享一篇NC上的文章。作者们利用12个肿瘤组织样本的空间转录组学分析来广泛表征肿瘤核心和肿瘤前缘转录组,还训练了三种基于机器学习概率的预测模型。除了用于测序的样本,还利用了GEO数据库中的单细胞测序数据( GSE103332 )和TCGA数据库。而研究中生成的空间转录组数据已经存入GEO数据库了( GSE208253 ) 下面一起来看看这篇文章吧!( 发表Nature、Science等杂志七十多篇论文的中科院老师 系统教您如何学习单细胞多组学、空间转录组和机器学习单细胞分析应用 )。 题目:空间转录组学揭示了独特且保守的肿瘤核心和边缘结构,可预测生存和靶向治疗反应 杂志:Nature Communications 影响因子:IF=16.6 发表时间:2023年8月 这篇文章数据很多很杂,但是我们可以大致分为这几个部分: 空间转录组分析:包括自测数据(12个样本)和来自GEO的单细胞 ………………………………

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