单细胞分析环境配置

主要观点总结

文章主要介绍了服务器上的R语言版本更新及单细胞分析环境配置的相关内容。

关键观点总结

关键观点1: 服务器R语言版本更新至4.4.0。

管理员提醒并更新了服务器上的R语言版本，并整理了新的帮助文档和注意事项。

关键观点2: 服务器上的单细胞分析环境配置。

尽管作者未能及时配置新服务器的单细胞分析环境，但提供了之前本地R语言更新时整理的单细胞分析常用R包清单。包括批量安装这些R包的代码示例。

关键观点3: 解决COSGR包安装问题。

强调了COSGR包的特殊性，在Github上可能无法顺利下载。提供了本地安装的方法和步骤，包括当命令下载不成功时如何处理。

文章预览

写在开头 在九月的某一天， 登录服务器惊喜的发现服务器上面的R版本也已经更新到4.4.0 然后发现在月初的时候，咱们服务器的管理员，就已经 提醒过大家会更新服务器上的R语言版本，并且整理R语言更新之后的帮助文档，整理了一些注意事项 刚开始登录更新完的服务器账号，看到R包还没有很多，还 想着说有机会给大家整理一下如何配置服务器的单细胞分析环境。 结果就是 拖延症小谢拖拖拖，拖到勤劳的同事把常用的R包都更新完了。。。 甚至贴心的安装好了 SeuratData！ 以及celldex这些配套的包。只能说 给咱们的离线管理员点个大大的赞！ 关于服务器使用体会 去年的时候就给大家分享过 网页版Rstudio安装与使用 ,那是当时 刚开始从我的小破电脑转到服务器开始去分析 。 后来 熟悉之后，已经可以使用服务器从下载单细胞数据，到跑完全部分析流 ………………………………