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大家好!为大家介绍一篇2024年09月发表在Nature Genetics的文章,题目为“Spatial transcriptomic analysis of primary and metastatic pancreatic cancers highlights tumor microenvironmental heterogeneity”。本文中,研究团队整合空间转录组学和生态型分析,绘制了PDAC肿瘤免疫微环境在解剖区域的分布。本文的通讯作者是美国印第安纳大学医学院梅尔文和布伦西蒙综合癌症中心阿希克·马苏德教授。 01 背景介绍 胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC)具有固有侵袭性,大多数患者确诊时就已经是晚期阶段或远端转移,仅约15%的患者可进行原位肿瘤切除手术。针对原发性和转移性PDAC进行的批量RNA-seq的研究发现,在肝转移样本中,上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)下调,M2巨噬细胞增加,并且补体系统活化。然而,批量转录组学方法只检测到样本平均的基因表达,忽
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