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Sci Rep | SLC35A3低表达的结直肠癌与免疫浸润和预后不良相关

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-12-05 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Colorectal cancer with low SLC35A3 is associated with immune infiltrates and poor prognosis ”,这篇文章发表在 Sci Rep 期刊上,影响因子为3.8。 结果: SLC 35 A3在结直肠癌患者中的表达 TIMER数据库用于确定SLC 35 A3在不同类型的恶性肿瘤中的总体表达水平。结果表明,SLC 35 A3在不同的癌症中具有不同的表达模式。与正常组织相比,SLC 35 A3 mRNA表达在结肠腺癌(COAD)和直肠腺癌(READ)中显著降低(图1A)。为了进一步确定SLC 35 A3在结直肠肿瘤和正常组织之间的差异表达,作者分析了TCGA-COADREAD数据集,该数据集包括来自647个结直肠腺癌组织和51个正常结肠组织的RNA测序数据和临床信息。结果显示,SLC 35 A3在CRC组织中显著下调(p < 0.001,图1B)。另外,作者分析了50对CRC组织和匹配的邻近正常组织中SLC 35 A3的表达水平,发现CRC组织中SLC ………………………………

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