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使用纳米孔进行蛋白测序又向前迈进了重要一步!

我是建设者  · 公众号  ·  · 2024-09-12 21:52

主要观点总结

本文介绍了华盛顿大学的Jeff Nivala团队在《自然》杂志上发表的研究,报道了一种直接读取蛋白质序列信息的方法。该方法通过将蛋白质链穿过膜上的蛋白纳米孔,利用离子电流的变化来确定氨基酸序列。尽管存在一些挑战,如蛋白质的三维结构、不均匀电荷和识别任意蛋白质序列等,但这一突破性的方法展示了纳米孔测序在蛋白质组分析中的潜力。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目标

一直以来,人们希望能够像读出句子中的字母一样读出任何蛋白质分子的氨基酸序列。此项研究旨在开发一种直接读取蛋白质序列信息的方法。

关键观点2: 研究方法

该研究使用了纳米孔技术,通过将蛋白质链穿过膜上的蛋白纳米孔,利用离子电流的变化来确定氨基酸序列。

关键观点3: 研究的关键创新

研究的关键在于开发了可附着在任何蛋白质上的“衔接子”序列,使其能够在一个纳米孔系统中加载、读取和重绕。

关键观点4: 研究的挑战

研究面临的挑战包括展开蛋白质、克服不均匀电荷、识别任意蛋白质序列等。此外,商用纳米孔的结构公开或转移到具有非专有结构的纳米孔可以加速纳米孔蛋白质测序平台的发展。

关键观点5: 研究成果

该研究实现了单分子纳米孔读取长度为数百个氨基酸的完整蛋白质链,这是一项突破性的方法,展示了纳米孔测序在蛋白质组分析中的潜力。


文章预览

人们一直希望能够像读出句子中的字母一样读出任何蛋白质分子的氨基酸序列。如今,这个梦想跟进了一步。 目前,对蛋白变体和修饰的检测和量化依赖于与蛋白质分子中特定基序具有高亲和力的生物分子,或依赖于对蛋白质切碎后产生的多肽片段的表征。然而,这两种方法都 无法提供绘制蛋白质变异类型和丰度所需的灵敏度 。 近日, 华盛顿大学的 Jeff Nivala团队 在《自然》杂志上发表文章(这项 研究在去年 10 月份发表了BioRxiv预印本 ),报道了一种直接读取蛋白质序列信息的方法,即将蛋白质链(每次几个氨基酸残基)穿过膜上的一个蛋白纳米孔。 1996 年,就有报道称当长生物聚合物分子被电场单向拉过纳米通道时,可以测量离子流过膜中生物通道(纳米孔)时产生的电流。电流的变化取决于离子流被生物聚合物上的化学基团阻滞的程度。 ………………………………

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