【一周新资讯--乳腺癌 317】2024 W3802

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05 单细胞染色质可及性揭示了原发性人类癌症中的恶性调控程序 主要研究结果： •  为了发现与癌症相关的基因调控变化，作为TCGA的一部分，在八个癌种中生成了单细胞染色质可及性图谱 • 肿瘤染色质可及性受到可用于识别亚克隆的拷贝数变化的强烈影响   • 顺式调控图谱保留了特有癌症类型的特征 • 使用匹配器官的健康组织，在多种癌症中发现了“最接近健康”的细胞类型，证明基底样亚型乳腺癌的染色质标签与分泌型Luminal上皮细胞最为相似 • 经训练的神经网络模型学习了癌症中的调控程序，揭示了模型优先的体细胞非编码突变在癌症相关基因附近的富集，提示癌症中分散的、非重复的、非编码突变是具有功能性的 参考文献： Sundaram L, Kumar A, Zatzman M, Salcedo A, Ravindra N, Shams S, Louie BH, Bagdatli ST, Myers MA, Sarmashghi S, Choi HY, Choi WY, Yost KE, Zhao ………………………………