锁定稀有癌型常规单细胞分析也可搞定6分纯生信

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脱贫和脱单路上选择了脱发，发财和发达的路上选择了发文章，今天分享一篇温州医科大周猛教授团队发的单细胞纯生信文章。 摘要 背景： 葡萄膜黑色素瘤（UM）是一种罕见且致命的眼部癌症，具有很高的转移潜力。尽管恶性肿瘤微环境中以恶性细胞为主，但其异质性和潜在的分子特征仍有待全面阐明。 方法 ： 对来自17例UM肿瘤的37,660个恶性细胞进行了单细胞转录组分析。使用共识非负分解算法来解析肿瘤细胞内在异质性背后的转录模式。通过整体转录组和生物信息学方法，对肿瘤浸润免疫细胞进行了计算估计。推导出了一个基因特征用于亚型划分和预后分层，并在多中心队列中进行了验证。 结果  ：单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤内和肿瘤间恶性细胞中存在不同的亚群和转录变异。此外，还观察到恶性细胞状态和组成的异质性与基因组、免疫学 ………………………………