【中国声音】Nature子刊 | 华山医院赵曜团队联合复旦大学丁琛团队揭示颅底脊索瘤蛋白质基因组特征，指导精准诊疗

主要观点总结

本文报道了复旦大学附属华山医院赵曜教授团队和复旦大学丁琛教授团队在 Nature Communications 杂志发表的研究论文，该研究通过多组学测序分析构建了颅底脊索瘤的蛋白质基因组特征图谱，揭示了其在基因组、蛋白质组和蛋白质翻译后修饰组的变化，包括染色体不稳定性、细胞周期、线粒体相关蛋白、DNA损伤修复等机制通路的参与，以及免疫分型和蛋白分型的研究。该研究为颅底脊索瘤的精准化临床诊疗奠定了基础。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景

颅底脊索瘤是一种强侵袭性、高复发率的恶性骨肿瘤，手术难全切，残瘤的治疗手段有限，预后极差。目前缺乏基于临床预后的蛋白质基因组分型，使得其诊疗靶点的探索面临困境。

关键观点2: 主要发现

研究通过多组学测序分析构建了颅底脊索瘤的蛋白质基因组特征图谱，揭示了基因组中的染色体不稳定性，以及与临床预后显著相关的肿瘤突变负荷低和特定的染色体扩增现象。

关键观点3: 研究亮点

研究通过比较基因组学和蛋白质组学的差异，发现了与细胞周期、线粒体功能、DNA损伤修复等相关的关键机制通路。此外，还通过免疫分型和蛋白分型研究，为后续颅底脊索瘤的精准化临床诊疗奠定了基础。

关键观点4: 研究团队和合作

研究团队包括复旦大学附属华山医院的赵曜教授团队和复旦大学丁琛教授团队，以及其他合作单位和研究员。该研究得到了多个基金项目的资助，包括国家重点研发计划、国家自然科学基金等。

关键观点5: 展望与未来

该研究为颅底脊索瘤的精准化诊疗策略提供了依据，但仍需要进一步的研究来验证和完善这些发现，并探索更多的治疗靶点。

文章预览

颅底脊索瘤（Skull-Base Chordoma，SBC） 为起源自胚胎期脊索残瘤组织的一类强侵袭性、高复发率的恶性骨肿瘤。因手术难全切，残瘤的治疗手段又极为有限（放疗抵抗率高，无切实有效的靶向药物），该类患者总体预后极差。目前，颅底脊索瘤尚无基于临床预后的蛋白质基因组分型，这使得其诊疗靶点的探索面临缺乏有效研究方向和基础数据的困境。 2024年9月27日， 复旦大学附属华山医院赵曜教授团队 和 复旦大学丁琛教授团队 合作，在 Nature 子刊 Nature Communications 杂志 在线发表题为 “Proteogenomic characterization of skull-base chordoma” 的研究论文。该研究通过包含基因组、转录组、蛋白质组和蛋白质翻译后修饰组的多组学测序分析，构建了颅底脊索瘤的蛋白质基因组特征图谱。在基因组层面，颅底脊索瘤中存在的染色体不稳定性，其与临床预后显著相关。 ………………………………