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研究进展:冷冻电镜-spIsoNet软件 | Nature Methods

今日新材料  · 公众号  ·  · 2024-11-19 01:58
    

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虽然单粒子冷冻电镜技术的进步,已经以原子分辨率,测定大分子复合物的结构。但对于大多数样品来说,粒子取向偏差(“优选”取向问题),仍然是复杂问题之一。现有的解决方案,取决于样本生化和物理策略,并且通常是复杂和具有挑战性的。 今日,美国加州大学Yun-Tao Liu, Hongcheng Fan,Z. Hong Zhou等,在Nature Methods上发文,开发了spIsoNet软件,这是一种端到端、自监督的基于深度学习软件,以解决偏好取向问题引起的各向异性和粒子未对准。 spIsoNet软件,利用优选取向视图,以恢复欠采样视图中的分子信息,提高了3D重建过程中的角度各向同性和粒子排列精度。 研究证明,spIsoNet软件从具有代表性的生物系统(包括核糖体、β-半乳糖苷酶和以前难以处理的血凝素三聚体数据集)中,生成近似各向同性的重建。 spIsoNet软件也可以推广,以改善子断 ………………………………

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