专栏名称: 细胞基因研究圈
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肿瘤浸润性T细胞单细胞RNA-seq数据集中进行TCR功能筛选

细胞基因研究圈  · 公众号  ·  · 2024-05-25 14:19
    

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单细胞RNA测序(scRNAseq)的出现使从组织中分离的数千个细胞能够进行深入的基因表达分析。报道了scRNAseq在解剖人胰腺癌样本中肿瘤浸润性T细胞库中的应用。在这项研究中,证明了结合全转录组和TCR测序为根据基因表达特征识别肿瘤反应性TCR克隆类型提供了一种有效的方法。一个重要方面是通过体外功能测定对TCR介导的抗肿瘤反应性进行实验验证。 该方法包括将编码TCRα/β的mRNA基因瞬时导入到定义明确的人T细胞系中,然后与感兴趣的肿瘤细胞共培养,并通过流式细胞仪检测T细胞的激活 。由于模拟转染组T细胞对多种肿瘤细胞的高转染性和低背景反应性, 该方法为scRNAseq数据集中鉴定的大量TCR克隆型的功能筛选提供了一个高度可靠和通用的平台 。虽然该方法最初是为了检测人类来源的TCR而开发的,但最近也成功地应用于筛选小鼠来源的TCR。 通过mRNA ………………………………

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