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Nature Methods丨叶明亮团队开发出在复杂体系中可同时鉴定配体靶蛋白质和结合位点的蛋白质组学新方法

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2024-12-16 09:01
    

主要观点总结

本文介绍了中国科学院大连化学物理研究所和叶明亮研究员团队与中国科学院上海药物研究所罗成研究员团队共同发表的一篇研究论文。该研究发展了一种肽段为中心的蛋白局部稳定性探测技术(PELSA),用于鉴定配体结合蛋白、结合区域以及局部亲和力。该技术具有自主知识产权,具有灵敏度高、特异性强、样品复杂度低等优点,可广泛应用于多种类型配体结合靶标蛋白的鉴定,并在代谢物靶蛋白鉴定领域展现出广阔的应用前景。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及重要性

揭示配体分子的生理功能和作用机制对于疾病治疗和药物研发具有重要意义。鉴定配体结合区域能为药物研发提供结合位点和药物-蛋白构效关系指导。

关键观点2: PELSA技术的原理及特点

PELSA技术基于配体结合蛋白微区域对酶切具有更高的耐受性而建立,可直接从细胞裂解液中确定配体的靶蛋白质、结合位点和结合亲和力。具有无需对配体进行化学修饰、高灵敏度、高特异性等优点。

关键观点3: PELSA技术与其他方法的优势比较

与LIP-MS及其它免修饰方法相比,PELSA技术具有更高的灵敏度,能更准确地鉴定配体结合蛋白和结合位点。在鉴定靶蛋白的灵敏度上,PELSA比LiP-MS高10倍以上,比LiP-Quant技术提高12倍,比TPP方法灵敏度也有显著提升。

关键观点4: PELSA技术在代谢物靶蛋白鉴定领域的应用

PELSA技术在代谢物靶蛋白鉴定领域具有广泛的应用价值,能够系统地鉴定代谢物的靶蛋白质。例如,在HeLa细胞裂解液中一次性鉴定到40个α-酮戊二酸的作用蛋白。此外,该技术还应用于叶酸、亮氨酸、富马酸及琥珀酸等代谢物的作用蛋白鉴定,展示了其广谱适用性。


文章预览

解析配体-蛋白相互作用有助于全面揭示配体分子的生理功能和作用机制,进而为疾病治疗以及药物研发提供新的思路。由于蛋白质并非均一的整体,大多数配体与蛋白的结合仅发生在蛋白质的局部区域。鉴定配体结合区域能够直接为药物研发提供可供结合的位点,同时为深入研究药物-蛋白构效关系提供重要指导。 2024年12月10日,中国科学院大连化学物理研究所 叶明亮 研究员团队和中国科学院上海药物研究所 罗成 研究员团队合作在 Nature Methods 期刊上发表研究论文,题为 A peptide-centric local stability assay enables proteome-scale identification of the protein targets and binding regions of diverse ligands 。 根据配体结合会导致蛋白质结合区域稳定性的改变进而影响酶切效率的原理,发展了一种肽段为中心的蛋白局部稳定性探测技术 (PEptide-centric Local Stability Assay, PELSA ) 用 ………………………………

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