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IVD前沿丨短和长引物的混合物可显著提高检测基因效率

小桔灯网  · 公众号  ·  · 2024-07-19 19:08

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来源:小桔灯网 作者:动力彩虹🌈 RNA分析是基因表达研究的一个重要方面,从基础研究到临床诊断都具有重要意义。绝大多数RNA分析的第一步是将RNA转录成cDNA。这个逆转录(RT)步骤具有重要意义,许多因素对RT的效率至关重要,如输入RNA的质量、引物策略、RT酶、缓冲液和反应条件。在引物方面,当目的是分析整个转录组时,广泛使用随机引物。随机引物最常用的引物是随机六聚体(6 mer)。然而,随机引物长度对RNA测序结果质量的影响尚不清楚。 近日,杂志Nature Communications上发表了一篇题为“Exploring the impact of primer length on efficient gene detection via high-throughput sequencing”的文章。在这里, 作者比较了不同长度的随机引物在从人脑总RNA生成RNA-seq文库中的表现。令人惊讶的是,结果表明,随机6mer并没有产生最佳的整体性能。相反,随机18mer引物在检测 ………………………………

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