Cell｜临床级FFPE样本空间全转录组测序技术

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引言 空间转录组学技术能够在生物组织原位绘制复杂的基因表达图谱，正在革新我们对发育生物学、免疫学、肿瘤学以及疾病病理学的理解【1】。然而，迄今为止，该领域的研究范围主要集中在信使RNA （mRNA） 表达的分析上。真核细胞的转录组由动态多样的RNA分子组成，不仅包括编码蛋白合成的成熟mRNA，还涵盖剪接变体、小RNA及其他具有调控功能的非编码RNA。因此，对不同RNA物种在其生命周期中的空间定位进行分析，对于全面解剖复杂组织中的RNA生物学至关重要。 此外，在临床实践中， 福尔马林固定石蜡包埋 （Formalin-fixed Paraffin-embedded， FFPE ） 组织是病理学诊断的基石。全世界的临床病理科积累了大量FFPE组织块，这些材料与详细的临床数据相结合，构成了尚未充分利用的人体生物学和转化研究的宝贵资源。然而，FFPE样本也带来了特定挑战。 ………………………………