GigaScience | 基因组所刘永鑫组-短读长宏基因组数据的去宿主污染软件评估

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研究论文 ● 期刊： GigaScience  (IF:11.8) ● 中文标题：短读长宏基因组数据的去宿主污染软件评估 ● 英文标题：Benchmarking short-read metagenomics tools for removing host contamination ● DOI： https://doi.org/10.1093/gigascience/giaf004  ● 第一作者：高云云、罗豪 ● 通讯作者：刘永鑫（ liuyongxin@caas.cn ） ● 合作作者：吕虎杰、杨海飞、Salsabeel Yousuf、黄适 ● 发表日期：2025-2-8 ● 主要单位： 中国农业科学院深圳农业基因组研究所、香港大学、伦敦帝国理工学院、青岛农业大学 摘要 背景 ：宏基因组测序技术的快速发展为探索微生物组在宿主健康与疾病中的复杂作用，以及揭示微生物群落的未知结构和功能提供了重要机遇。然而，宏基因组数据的迅速积累也给数据分析带来了巨大挑战。宿主DNA的污染可能显著影响结果的准确性，并因包含非目标序列而增加额外的计算资 ………………………………