中国青年学者一作！纯计算发JACS：RNA在蛋白质纳米孔测序中的二级结构演变及分子成像机制

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纳米孔测序技术是一种基于单分子实时分析的先进测序方法，通过监测核酸或多肽分子通过纳米孔时电流信号的变化获取其序列信息。该技术无需扩增或标记，能够快速地读取长链核酸分子序列，广泛应用于基因组学研究和临床。然而，待测分子在通过纳米孔时的二级结构变化会显著影响测序电流信号的稳定性和准确性。同时，现有实验手段难以实时获取分子过孔过程中的构象变化信息。 分子动力学模拟为研究这一过程提供了有效工具。全原子分子动力学模拟能够较为准确地预测核酸或多肽的二级结构，但受限于其时间尺度较短（仅上百纳秒），无法完整描述长时间尺度的过孔行为（超过百微秒乃至上千微秒）。粗粒化分子动力学模拟方法虽然在时间尺度上具有优势，但此前没有相关模拟工作实现带有二级结构的生物分子通过蛋白质纳米孔。其原 ………………………………