基于171种猴痘病毒蛋白质的完整单点突变图谱，探索潜在疫苗及药物开发途径

主要观点总结

本文介绍了关于猴痘病毒（MPXV）的研究，包括其基因组、突变影响以及治疗策略。文章重点介绍了法国索邦大学和土耳其Van Yüzüncü Yıl大学的科研人员对MPXV蛋白质组的单点突变图谱进行的全面计算分析。

关键观点总结

关键观点1: 猴痘病毒（MPXV）的基因组大小和编码的蛋白质数量。

MPXV具有一个约197kb大小的双链DNA基因组，编码约180种蛋白质。

关键观点2: MPXV的突变率和近年来出现的毒株的变异情况。

MPXV的突变率相对较低，但近年来出现的毒株中观察到显著的变异，强调了监测和基因组分析的重要性。

关键观点3: 研究团队利用ProteinGym数据集选择了最佳病毒蛋白突变效应预测算法。

研究团队选择了ESCOTT和iGEMME作为最佳病毒蛋白突变效应预测算法，并基于这些算法重建了171种MPXV蛋白的完整单点突变图谱。

关键观点4: 研究团队对MPXV蛋白质结构的质量进行了评估。

研究团队使用Colabfold生成了蛋白质结构，并通过pLDDT等方法评估了结构质量。

关键观点5: 研究团队提出了平均基因突变敏感性（AGMS）这一新指标。

研究团队使用ESCOTT结果计算了AGMS，并筛选出得分最高的20个基因，这些基因可作为潜在的药物/疫苗靶标。

文章预览

猴痘是由猴痘病毒（MPXV）引起的一种人畜共患传染病，常见症状包括发热、淋巴结肿大和全身水疱脓疱等；MPXV为痘病毒科正痘病毒属，具有两个不同的进化枝：进化枝I和进化枝II。2024年8月14日，世界卫生组织宣布猴痘疫情为国际关注的突发公共卫生事件。了解MPXV突变的影响对于评估病毒的进化以及开发新型疫苗或疗法至关重要但目前还未有系统性研究其变异效应的实验方法。因此，对MPXV基因组单点突变景观的计算预测是理解病毒进化、流行病学和治疗干预潜在应答的重要前沿。 MPXV具有一个约197kb大小的双链DNA基因组，编码约180种蛋白质。与RNA病毒相比，MPXV的突变率相对较低，但近年来，特别是2022年后出现的毒株中观察到显著的变异，这种差异强调了持续监测和基因组分析对检测病毒进化和潜在适应性变化的重要性。通过利用计算工具来预测 ………………………………