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单细胞实战之Scissor和BayesPrism映射——入门到进阶(初级篇4)

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2025-02-15 23:27
    

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我们在上一讲内容中学习了 pseudobulks和GSVA富集分析 ~ 接下来我们我们学习一下 两个“映射”工具——Scissor和BayesPrism 。同时本次分析还需要TCGA-COAD的数据,可以自己清洗数据,也可以直接下载网盘内容分享的文件:TCGA-COAD_sur_model.Rdata  链接: https://pan.baidu.com/s/18ZawCeYKkUMvwC9QVQ9yhA 提取码: xhab 映射工具 在做基础实验的时候,研究者都希望能够改变各种条件来进行对比分析,从而探索自己所感兴趣的方向。在做数据分析的时候也是一样的,我们希望有一个数据集能够附加了很多临床信息/表型,然后二次分析者们就可以进一步挖掘。然而现实情况总是数据集质量非常不错,但是附加的临床信息/表型却十分有限,这种状况在单细胞数据分析时代中更加常见。因此如何将大量的含有临床信息/表型的bulkRNA测序数据和单细胞数据构成联系,这也是算法开发者 ………………………………

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